遺伝子ネットワークにおける周期発現パターン遷移列の位相・周期感度の解析法

カテゴリ: 研究会(論文単位)

論文No: ST18047

グループ名: 【C】電子・情報・システム部門 システム研究会

発行日: 2018/09/26

タイトル(英語): Analysis method of phase and period sensitivity for cyclic expression pattern sequences in gene regulatory networks

著者名: 森 禎弘(京都工芸繊維大学),黒江 康明(京都工芸繊維大学)

著者名(英語): Yoshihiro Mori(Kyoto Institute of Technology),Yasuaki Kuroe(Kyoto Institute of Technology)

キーワード: 遺伝子ネットワーク|感度解析|周期感度|位相感度|gene regulatory network|sensitivity analysis|period sensitivity|phase sensitivity

要約(日本語): 生体には様々なリズム現象が存在し、その多くは遺伝子ネットワーク(GRN)によって司られている。本稿では、GRNのリズム現象の特徴量である位相と周期の感度解析法を提案する。感度は通常、感度方程式あるいは随伴方程式を導出し、これらを解くことにより求めることが一般的である。本稿では区分的に線形なGRNのモデルに対し、これらの方程式を求めることなく解析的に感度を求める方法を提案する。

要約(英語): There are many periodic phenomena in organisms which are governed by gene regulatory networks(GRNs). This paper proposes a method of sensitivity analysis of phase and period for periodic phenomena in GRNs. For calculating sensitivities, in general, sensitivity equations or adjoint equations are derived, and the equations are solved. In the proposed method, for a piece-wise linear model of GRN, sensitivities can be obtained analytically without solving the equations.

原稿種別: 日本語

PDFファイルサイズ: 1,076 Kバイト